Napromienianie osi czaszkowo-rdzeniowej jest korzystne dla pacjentów z zaburzeniami czaszkowo-twarzowymi, którzy pomimo intensywnego leczenia ogólnoustrojowego:
Celem jest również pozbycie się tych trudno dostępnych obszarów komórek białaczkowych, nawet tych, które nie są już wrażliwe na leczenie chemioterapią lub terapią biologiczną.
W tym przypadku radioterapia protonowa ma duże zalety w porównaniu z innymi formami radioterapii. Należą do nich zerowe obciążenie promieniowaniem narządów przed trzonami kręgowymi, minimalna toksyczność ogólnoustrojowa (zmniejszenie nudności, wymiotów, biegunki) i jest odpowiednia dla pacjentów poddanych intensywnemu leczeniu wstępnemu z konieczną redukcją dawki na płuca, przewód pokarmowy, serce i inne narządy.