Radioterapie má v léčbě nádorů CNS svou nezastupitelnou roli. Protonová radioterapie přináší v léčbě nádorů mozku a míchy zcela nové možnosti. Zvláště v případě nádorů inoperabilních z důvodu lokalizace v blízkosti životně důležitých oblastí nebo po nekompletně provedených exstirpacích (operacích) protonová radioterapie významně zlepšuje léčebné výsledky při zachování dobré kvality života pacienta.
Protonové centrum v Praze používá inovativní postupy léčby, které minimalizují nežádoucí ozáření okolních zdravých tkání, jako je např. zrakový a sluchový nerv, hippocampus nebo mozkový kmen apod. Přínos protonové radioterapie centrální nervové soustavy se tak projevuje již v průběhu léčby, kdy naprostá většina pacientů zvládne léčbu bez hospitalizace.