Leukemické postižení centrální nervové soustavy patří mezi nejnovější diagnózy určené k protonové léčbě.
Ozáření kraniospinální osy je přínosné právě pro pacienty, kteří mají i přes intenzivní systémovou léčbu:
Cílem je zbavit také tyto těžce dostupné prostory leukemických buněk, a to i těch, které již nejsou citlivé na léčbu chemoterapií či biologickou léčbou.
Protonová radioterapie má v tomto případě zásadní výhody oproti ostatním formám radioterapie. Jsou to nulová radiační zátěž orgánů před obratlovými těly, minimální systémová toxicita (redukce nausey, zvracení, průjmu), a je vhodná pro vysoce předléčené pacienty s nutnou redukcí dávky na plíce, střevní kličky, srdce a další orgány.